structure prediction 썸네일형 리스트형 MQAP #1 McGuffin - ModFOLD [공부,개발,생물정보학이야기] - CASP8 Model Quality Assessment (MQA) 글에서 MQA 분야에 대해서 소개하고, CASP8 결과를 요약했었습니다. 이번에는 CASP8 에서 좋은 성능을 발위한 서버 중 ModFOLD 논문을 요약해 보겠습니다. McGuffin 팀에서는 총 3개의 Program 으로 참석을 하였습니다. 199 : ModFOLD server 1.1 : QMODE1 을 위한 Automated Prediction server. Machine-Learning 기법에 기반하여 Global Model Quality 를 측정하는 프로그램 입니다. 031 : ModFOLDclust : Clustering 기법에 기반하여 global 과 local model qualrity 를 측.. 더보기 CASP8 Model Quality Assessment (MQA) CASP9 때 팀에서 Quality Assessment 부분에 참여하게 되어서 CASP8 에서 이루어졌던 Quality Assessment Category 의 결과를 정리해 봅니다. 지난 10년간 단백질 구조 예측은 얼마나 발전했을까요? 도서관에 있는 단백질 모델링에 관한 책과 단백질 구조의 현재를 가장 잘 알 수 있는 최근 CASP 결과를 비교해 보면, 알 수 있습니다. 과거에 단백질 구조 예측은 Ab inito, Threading, Homology Modeling 이라는 3분야로 구분을 했지만, 지금은 Free Modeling(FM) 과 Template-Based Modeling(TBM) 이라는 두 분야로 나누고 있습니다. 또한 Homology Modeling 분야에서 Best Template 보다 .. 더보기 이전 1 다음