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The FALC-Loop web server for protein loop modeling Junsu Ko, Dongseon Lee, Hahnbeom Park, Evangelos A. Coutsias, Julian Lee3,* and Chaok Seok1,* Nucl. Acids Res. (2011) doi: 10.1093/nar/gkr352 The FALC-Loop web server provides an online interface for protein loop modeling by employing an ab initio loop modeling method called FALC (fragment assembly and analytical loop closure). The server may be used to construct loop regions in homology modelin.. 더보기
LigDockCSA: protein-ligand docking using conformational space annealing Woong-Hee Shin, Lim Heo, Juyong Lee, Junsu Ko, Chaok Seok, Jooyoung Lee [Journal Link] Abstract Protein–ligand docking techniques are one of the essential tools for structure-based drug design. Two major components of a successful docking program are an efficient search method and an accurate scoring function. In this work, a new docking method called LigDockCSA is developed by using a powerful .. 더보기
A protein domain interaction interface database: InterPare A protein domain interaction interface database: InterPare Sungsam Gong, Changbum Park, Hansol Choi, Junsu Ko, Insoo Jang, Jungsul Lee, Dan M Bolser, Donghoon Oh, Deok-Soo Kim and Jong Bhak BMC Bioinformatics 2005, 6:207 Background Most proteins function by interacting with other molecules. Their interaction interfaces are highly conserved throughout evolution to avoid undesirable interactions t.. 더보기
Protein Motif Extraction via Feature Interval Selection Journal of the Korean Data & Information Science Society 2006, Vol. 17, No 4, pp. 1279-1287 더보기
Refinement of protein termini in template-based modeling using conformational space annealing Hahnbeom Park, Junsu Ko, Keehyoung Joo, Julian Lee, Chaok Seok*, and Jooyoung Lee* Keywords: protein structure prediction protein structure refinement protein terminus modeling CASP fragment assembly Abstract The rapid increase in the number of experimentally determined protein structures in recent years enables us to obtain more reliable protein tertiary structure models than ever by template-b.. 더보기
땅콩초코렛 쿠키 만들기 이번 글은 요즘 아내에게 가장 사랑 받고 있는 네오스표 쿠키 입니다. 아내가 군것 질 하는 것을 많이 좋아하는데, 요즘 쿠키를 자꾸 먹고 싶다고 하는 군요. 임신하기 전이야 몸에 안 좋다고 못 먹게 했었는데, 지금은 먹고 싶다는 건 다 사줘야 하는 입장이라서, 어찌 할까 고민 좀하다가 그냥 만들어 주기로 결정했습니다. 늘 그렇듯 인터넷을 찾아서 가장 맛있어보이고 집에 있는 재료료 가능한 요리법을 찾은 뒤에 열심히 만들었는데요. 이게 참 잘 만들어져서 아내가 정말 좋아합니다. 덕분에 주말 마다 만들어 주고 있네요. 재료 배합도 기록할 겸. 만드는 법도 공유할 겸 블로그에 글도 하나 올리겸 쿠키 만들기를 올려 봅니다. 재료 준비 버터 70g 땅콩버터 40g 설탕 30g 계란 1개 바닐라향 가루 밥숫가락 반개.. 더보기
UE Triple Fi - 막귀를 깨우다. 작년말 아마존에서 Triple. Fi (트파) 라는 당시 국내가 40만원(지금은 30만원 정도 할겁니다.) 이라는 고가 이어폰을 99달러(약12만원)에 판매하는 이벤트를 했습니다. 재작년에 이어서 두번째 하는 이벤트였던 것으로 기억하는데요. 재작년에는 이런 고가 이어폰은 나한테 무리야 하는 생각에 구입하지 않았지만, 그 이후에 올라오는 수많은 후기들을 보면서 많이 아쉬워했었죠. 그래서 작년 이벤트때는 저도 참여를 해서 구입을 했습니다.그때 구입한 이어폰이 어찌 어찌 해서 이제 사용할 수 있게 되었습니다.^^ 몇 일 사용해보고 마음에 들어서 블로그에 음악분류도 만들고, 첫 글로 Triple Fi 개봉기도 올립니다. 이어폰으로 음악을 듣는다는 것은 "외부와 단절 시켜서 집중을 좋게 해준다(50%)"와 "가끔.. 더보기
Notion Ink Adam 보호 필름 입히기 Adam 에 보호필름 입혔습니다. 당연히 전신 보호 필름이 팔지는 않고, PPF 보호필름 구입해서 재단해서 붙였습니다. 노트북이나 핸드폰 타블렛에 비싼 돈 들여서 보호필름 입히시는데, 그냥 PPF 필름 구입해서 붙이셔도 됩니다. 가격도 아주 저렴하구요. 나중에 보호필름 교체할때 인쇄된거 지워질까봐 테입을 붙이고 위에 발랐는데, 테이프가 너무 티나는 군요. ㅡㅡ;; 보호필름은 크기가 딱 맞춰서 잘 붙었네요. 아. 행복해라. ㅎㅎ 더보기

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